Уважаемый Андрей!  В Вашем случае обязательно при любой вирусной или бактериальной инфекции необходим прием антибиотиков, в том числе профилактический ( 5 дней), если нет показаний их применять по поводу заболевания. Также Вам необходимо проводить профилактику эндокардита перед стоматологическими манипуляциями (любыми)- перед визитом к стоматологу и в течение суток после процедуры, если нет других рекомендаций от врача.
Обычно используют полусинтетические пенициллины
( амоксициллин, например). Дозы и режим приема уточняйте у Вашего терапевта!